[BBC] 24-36 months postdoc in Marseille: bioinformatics of marine metagenomes

[Delphine Potier]

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The Genomics and Structural Information Laboratory is seeking a postdoctoral fellow for a 24-36 months contract.
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Localisation: Marseille (Luminy Campus) FRANCE - IGS Laboratory CNRS UMR7256

Starting date: as soon as possible (as early as April 2012)

Duration: initially “postdoctoral” contract for 24 months, possibly followed by a further 12 months as “researcher” (short term contracts administered by CNRS)

Monthly salary: around 2000-2500 euros net depending on experience

Funding: European FP7 project MicroB3 (4 years, started 1st January 2012)
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Scientific context:
The IGS laboratory in Marseille contributes to the exploration of the ocean ecosystem within the European MicroB3 consortium (Biodiversity, Bioinformatics, Biotechnology - http://www.microb3.eu/). The candidate, integrated in a bioinformatics team, will participate in the development of methods for the analysis of marine viral biodiversity estimated from very large scale metagenomics datasets (including data produced by the TARA OCEANS consortium http://oceans.taraexpeditions.org/).

Qualifications and Experience:
Applicants should hold a PhD and solid experience in bioinformatics. Proven skills in programing are essential. Familiarity with one or several of the following would be an advantage: manipulation of ultra-high throughput sequencing datasets (454, Illumina HiSEQ), metagenome analysis, marine plankton biodiversity, environmental virology.
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Interested candidates should send their application by email to : pascal.hingamp at univ-amu.fr<mailto:pascal.hingamp at univ-amu.fr> andHiroyuki.Ogata at igs.cnrs-mrs.fr<mailto:Hiroyuki.Ogata at igs.cnrs-mrs.fr>.

The application should include a cover letter stating earliest starting date, a detailed CV and the email addresses of three referees.

*[FR]****************************************************************************
Le laboratoire Information Génomique et Structurale recrute un chercheur post-doctorant pour 24-36 mois.
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Localisation: Marseille (Campus de Luminy) - Laboratoire IGS CNRS UMR7256

Date de démarrage: poste à pourvoir immédiatement (dès avril 2012)

Durée: initialement CDD “postdoctoral” de 24 mois, puis possibilité de 12 mois supplémentaires en CDD “chercheur” (contrats gérés par le CNRS)

Salaire net mensuel: environ 2000-2500 euros net selon expérience

Financement: projet Européen FP7 MicroB3 (4 ans, démarré le 1er janvier 2012)
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Contexte scientifique:
Le laboratoire IGS à Marseille contribue à l'exploration de l'écosystème marin dans le cadre du projet Européen MicroB3 (Biodiversity, Bioinformatics, Biotechnology - http://www.microb3.eu/). Le ou la candidat(e), intégré(e) dans une équipe de bioinformaticiens, participera au développement de méthodes d'analyse de la biodiversité des virus marins à partir de données métagénomiques à très grande échelle (notamment issues du projet TARA OCEANS http://oceans.taraexpeditions.org/).

Profil:
Les candidats devront avoir un doctorat et une solide expérience en bioinformatique. Des compétences éprouvées en programmation sont indispensables. Une expérience dans un ou plusieurs domaines suivants serait très appréciée: traitement de données de séquençage à haut débit
(454, Illumina HiSEQ), analyse de séquences métagénomiques, biodiversité du plancton marin, virologie environnementale.
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Les personnes intéressées doivent adresser leur candidature par email à pascal.hingamp at univ-amu.fr<mailto:pascal.hingamp at univ-amu.fr> etHiroyuki.Ogata at igs.cnrs-mrs.fr<mailto:Hiroyuki.Ogata at igs.cnrs-mrs.fr>.

Les dossiers de candidature devront inclure une lettre de motivation précisant la date à laquelle le candidat serait disponible, un CV détaillé en anglais, et les noms et coordonnées de courriel de 3 références.
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