[BBC] HPC / cloud Linux sysopsdevops met interesse in big data DNA en RNA analyses

[Patrick Deelen]

Werkomgeving

We zoeken een ervaren Linux system administrator voor in het Genomics
Coordination Center (GCC), de ‘big data’ research & service hub van het
Universitair Medisch Centrum Groningen, afdeling Genetica. Het zijn
spannende tijden met biotechnologie die terabytes aan Biobank, DNA-, gen-,
mutatie-, eiwit- moleculaire- en fenotype profielen oplevert. Dit biedt
ongekende mogelijkheden voor het voorspellen van ziekte en gezondheid, maar
ook grote uitdagingen in het delen, (her)gebruiken en analyseren van al
deze nieuwe, maar vaak gevoelige data. Wij werken daarom met 25 collega’s
in diverse lokale, nationale en EU projecten aan slimme software om
mensgebonden onderzoek te versnellen en zorg te verbeteren met open source
web applicaties (zie http://github.com/molgenis), (HPC) analyse pipelines
en grootschalige e-infrastructuur (cluster, storage, cloud). Op deze manier
draagt GCC in belangrijke mate bij aan het FAIR maken van research data en
wetenschappelijk onderzoek. Hierbij hanteren we een agile aanpak.
Functiebeschrijving

Wij zoeken een ervaren Linux sysops of devops voor het functioneel beheer
van onze vier HPC rekenclusters (30 nodes, 1000+ cpu, 1 petabyte) en onze 8
OpenStack ‘cloud’ servers (100 VMs met onze MOLGENIS software), inclusief
geautomatiseerd configuratie management, autorisatie systemen, monitoring,
verbetervoorstellen en ontwerpen en inrichten van nieuwe systemen en nieuwe
technologieen. Je werkt tussen een team van 6 bioinformatici met als missie
geautomatiseerde pipelines voor grootschalige DNA en RNA data analyse ten
behoeve van onderzoek en diagnostiek, en 6 software engineers die
webapplicaties maken voor analyse van wetenschappelijke en zorgdata. Verder
werk je in nauwe samenwerking met het Centrum voor Informatie Technologie
(CIT) van de Rijksuniversiteit Groningen die al onze IT faciliteiten
technisch beheren en collega systeem beheerders bij UMCG en onze nationale
en Europese samenwerkingspartners en heb je veel multidisciplinair contact
met toponderzoekers, (bio)statistici, diagnostici en artsen.
Wat vragen wij

De ideale kandidaat is professioneel Linux beheerder:

   - met aantoonbare ervaring in cloudomgeving en/of HPC computer clusters
   - is communicatief vaardig, klantvriendelijk en werkt nauwkeurig
   - heeft goede mondelinge en schriftelijke uitdrukkingsvaardigheden
   - kan zowel zelfstandig als in teamverband werken
   - is initiatiefrijk en heeft een proactieve houding
   - heeft een goede beheersing van de Nederlandse en Engelse taal in woord
   en geschrift.

We verwachten HBO of WO achtergrond. Ervaring met wetenschappelijk
onderzoek of het werken in een academische omgeving is een pre. Kennis van
SLURM, PBS, postgresql, R, python, virtualisatie/cloud technologie,
microservice infrastructuur, configuratie management tools (ansible,
puppet, easybuild, etc), container technologie (Docker), firewalls,
continuous delivery, etc, is een pre. Ook achtergrond in Windows wordt
gewaardeerd voor kleine hulp in onze ziekenhuisomgeving.

Het UMCG voert een preventief Hepatitis B beleid. Dit kan betekenen dat u
voldoende bescherming tegen Hepatitis B moet hebben opgebouwd voordat u
kunt worden aangesteld. Indien nodig verzorgt het UMCG de vaccinatie.
Wat bieden wij

Een aanstelling voor 0.8 fte als Linux systeembeheerder in een boeiende
omgeving en met ruimte om veel nieuwe kennis op te doen, voor één jaar, met
een mogelijke verlenging.
Uw salaris bedraagt minimaal € 2.178,- tot maximaal € 3.339,- bruto per
maand (schaal 7 of 8) afhankelijk van kwalificaties en op basis van een
fulltime aanstelling. Daarnaast biedt het UMCG 8% vakantietoeslag, 8,3%
eindejaarsuitkering en een budget voor ontwikkeling. Arbeidsvoorwaarden
conform de CAO Universitair Medische Centra (CAO-UMC).

*Meer informatie*
Neem voor meer informatie contact op met:
dr. Pieter Neerincx, coördinator e-infrastructuur, of dr. Elisa Hoekstra,
hoofd analyse team, of prof.dr. Morris Swertz, hoofd Genomics Coordination
Center, via telefoon +31 (0) 50 361 7100 of e-mail:
pieter.neerincx at gmail.com (e-mailadres niet gebruiken voor sollicitaties).
SolliciterenU kunt uitsluitend reageren via het digitale
sollicitatieformulier onderaan deze pagina.
Solliciteren kan tot en met *11 april 2017*.
Meteen na het verzenden van het digitale sollicitatieformulier wordt een
ontvangstbevestiging gemaild met nadere informatie.

​http://www.umcg.nl/NL/UMCG/Werken_in_het_UMCG/Vacatures/Externe_vacatures/
Managementondersteuning/Paginas/HPC__cloud_Linux_
sysopsdevops_met_interesse_in_big_data_DNA_en_RNA_analyses.aspx
-------------- next part --------------
An HTML attachment was scrubbed...
URL: <http://maillist.psb.ugent.be/pipermail/bbclist/attachments/20170331/e43eeaa2/attachment.html>