<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
<div class="">Dear all,</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">There are two upcoming postdoc opportunities in my lab. Interested? Please contact me:
<a href="mailto:j.deridder-4@umcutrecht.nl" class="">j.deridder-4@umcutrecht.nl</a></div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><b class="">Position 1 - Biomarker discovery for on-chip detection of methylated DNA sequences</b></div>
<div class="">This will be a collaboration with Nanomed Diagnostics, a start-up company (starting in 2017) that has spun-off from the&nbsp;University of Twente (UT). The company is developing a chip and read-out device that can be used for the rapid detection of&nbsp;cancer
 from urine (The urine-chip). The technology is based on the on-chip detection of methylated DNA sequences enriched in&nbsp;the urine of cancer patients. You will be in charge of the discovery of novel methylation-based biomarkers from public data using cloud-based
 machine learning techniques.&nbsp;</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><b class="">Position 2 - Googling the cancer genome: Identification and prioritization of relevant structural variations in&nbsp;whole genome sequencing data of cancer patients</b></div>
<div class="">You will develop new analytical and computational methods that enable fast and cost-efficient detection of all&nbsp;structural variants in whole genome sequencing data. In addition, machine-learned ranking technologies will be employed to uncover clinically&nbsp;relevant
 structural variants among the vast numbers of irrelevant variants. The project will be carried out in collaboration with a team of eScience engineers from the Netherlands eScience Center.&nbsp;</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><b class="">About the lab</b></div>
<div class="">In the de Ridder lab we create and apply innovative data science methods to advance our understanding of disease biology. Our research efforts are&nbsp;always inspired by a biological question and typically deal with big data, such as large-scale genomics
 and epigenomics&nbsp;datasets. As a result, much of the research floats on machine learning and data integration algorithms. We also heavily rely on&nbsp;high-performance computing and statistics.&nbsp;Typical projects of the lab include the integration of genome conformation
 measurements (4C and Hi-C) with genome-wide&nbsp;screening data, annotation and prioritization of non-coding variations (SVs and SNVs) and interpretable classification models for&nbsp;patient cohort data.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
<div style="orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; widows: auto; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
<div style="orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; widows: auto; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
<div style="orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; widows: auto; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
--</div>
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
<b class="">Jeroen de Ridder, PhD&nbsp;</b></div>
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
<br class="">
</div>
<div class="">Associate professor / Principal Investigator | University Medical Center Utrecht - Center for Molecular Medicine |<span class="Apple-converted-space">&nbsp;</span><b class="">Address:<span class="Apple-converted-space">&nbsp;</span></b>&nbsp;Universiteitsweg
 100, &nbsp;STR 1.305 | 3584 CG Utrecht, The Netherlands |<span class="Apple-converted-space">&nbsp;</span><b class="">Tel:&nbsp;</b>&#43;31 (0)88 7550406 |<span class="Apple-converted-space">&nbsp;</span><b class="">Mob:&nbsp;</b>&#43;31 (0)6 24288813 |<span class="Apple-converted-space">&nbsp;</span><b class="">Skype:</b>&nbsp;j_de_ridder
 |<span class="Apple-converted-space">&nbsp;</span><b class="">Secretary:<span class="Apple-converted-space">&nbsp;</span></b>Monique van Schaik,&nbsp;<a href="mailto:M.A.H.vanSchaick@umcutrecht.nl" class="">M.A.H.vanSchaick@umcutrecht.nl</a>, &#43;31 (0)88 7568312</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
<br class="">
<hr>

<p><font size="-2" face="arial" color="black"><i>
De informatie opgenomen in dit bericht kan vertrouwelijk zijn en is
uitsluitend bestemd voor de geadresseerde. Indien u dit bericht onterecht
ontvangt, wordt u verzocht de inhoud niet te gebruiken en de afzender direct
te informeren door het bericht te retourneren. Het Universitair Medisch
Centrum Utrecht is een publiekrechtelijke rechtspersoon in de zin van de W.H.W.
(Wet Hoger Onderwijs en Wetenschappelijk Onderzoek) en staat geregistreerd bij
de Kamer van Koophandel voor Midden-Nederland onder nr. 30244197.
</i></font></p>

<p><font size="-2" face="arial"  color="green"><i>
Denk s.v.p aan het milieu voor u deze e-mail afdrukt.
</i></font></p>

<hr>

<p><font size="-2"  face="arial" color="black"><i>
This message may contain confidential information and is intended
exclusively for the addressee. If you receive this message
unintentionally, please do not use the contents but notify the sender
immediately by return e-mail. University Medical Center Utrecht is a legal
person by public law and is registered at the Chamber of Commerce for
Midden-Nederland under no. 30244197.
</i></font></p>

<p><font size="-2"  face="arial" color="green"><i>
Please consider the environment before printing this e-mail.
</i></font></p>
</body>
</html>