Vacature: Data analist

36 uur, vast contract, bepaalde tijd

Analyseren van Next Generation Sequencing data binnen de diagnostiek

Werkomgeving

De afdeling klinische genetica is verantwoordelijk voor het diagnosticeren van (mogelijke) genetische/erfelijke afwijkingen, zowel bij kinderen en volwassenen maar ook steeds meer bij embryo's vroeg in de zwangerschap. Er wordt hierbij intensief gebruik gemaakt van in-house Next Generation Sequencing capaciteit. Zo gebruikt onze afdeling momenteel deze techniek voor analyse van genpakketten, exomen (WES) en niet-invasieve prenatale diagnostiek (NIPT). Vanwege de enorme toename van het gebruik van NGS is de afdeling is op zoek naar uitbreiding van haar bioinformatica team met een data analist. Deze heeft de verantwoordelijkheid de grote datastromen die hiermee gegenereerd worden te beheersen en op een efficiënte en effectieve manier beschikbaar te maken in de praktijk van de kliniek.

Werkzaamheden

Als Data analist zijn je voornaamste taken:

• Het runnen van verschillende diagnostische pipelines/flows;
• Uitvoeren van periodieke checks en genereren van statistieken ten behoeve van quality control;
• Troubleshooting binnen onze bioinformatische pipelines;
• Managen van de data die door de sequencing faciliteit gegenereerd wordt;
• Beheren en ontwikkelen van de soft- en hardware infrastructuur;
• Schrijven van pipelines om data te kunnen verwerken;
• Testen van software voor gebruik in de diagnostiek (validatie);
• Opstellen en reviseren van protocollen (SOPs);
• Het signaleren van afwijkende resultaten.

Jouw profiel

Wij zoeken een Data analist die de volgende kennis en ervaring met zich meebrengt:

• Afgeronde WO/HBO opleiding informatica/bioinformatica;
• Ervaring met het werken met pipelines;
• Ervaring met Python en Bash in een Linux omgeving;
• Ervaring met het werken met cluster computers is een pré;
• Ervaring in de genetica is niet nodig, interesse hierin is echter wenselijk;
• Je neemt initiatief, bent analytisch, stressbestendig en inventief.

Wij bieden

Salarisschaal 9: 2689 tot 3704 euro bruto bij een fulltime dienstverband (afhankelijk van opleiding en ervaring).

Inschaling in salarisschaal 10 is bij de juiste opleiding en ervaring bespreekbaar.

Naast een uitstekend basissalaris bieden we onder andere 8,3% eindejaarsuitkering en 8% vakantietoeslag. Voor meer informatie over onze voorwaarden zie: http://www.werkenbijvumc.nl/vumc/arbeidsvoorwaarden/

Wij bieden in eerste instantie een contract voor 12 maanden, dat bij goed functioneren kan worden verlengd.

Pas jij bij VUmc? Doe de test! http://www.werkenbijvumc.nl/vumc/cultuur/

Bijzonderheden

Voor meer informatie over de selectieprocedure kunt je terecht bij Wessel Haytink, recruiter, via telefoonnummer: 06 - 1066 7718.

Interesse?

Wil je meer informatie over de functie dan kun je contact opnemen met dr. E.A. Sistermans, hoofd genoomdiagnostiek via 020-4448346 of met Daphne van Beek, bio-informaticus via 020-4443092. Je kunt uiterlijk tot 8 juli 2014 solliciteren via deze link.