[Beg-bogas] Esi0011_0004 kapot

Esi0011_0004 Offset:1849 FT CDS_before join(complement(745..1152),complement(1791..1878), FT CDS_before join(complement(3190..3358),complement(4684..4814)) FT CDS_after join(16108..16247,16956..17106,17921..18054,18654..18753, FT CDS_after join(complement(26734..26889)) FT CDS join(complement(7438..7452),complement(8122..8286), ... FT BLASTN_HIT join(complement(61227..61633),complement(61756..61760), FT BLASTN_HIT complement(61316..61518) FT BLASTN_HIT complement(61227..61633) ... SQ Sequence 27479 BP; 6285 A; 7148 C; 7231 G; 5839 T; 976 other; Het is duidelijk dat die BLASTN_HITS nog niet in de buurt komen om in die sequentie te vallen. Twee mogelijke oplossingen: - Die BLASTN_HITS worden niet in de EMBL gestoken - Ik pas Artemini aan zodat features die niet binnen de sequentie passen, gewoon worden weggelaten. groeten Thomas

Werkt nog altijd niet, is dat normaal? Thomas Abeel wrote:
Esi0011_0004 Offset:1849
FT CDS_before join(complement(745..1152),complement(1791..1878), FT CDS_before join(complement(3190..3358),complement(4684..4814)) FT CDS_after join(16108..16247,16956..17106,17921..18054,18654..18753, FT CDS_after join(complement(26734..26889)) FT CDS join(complement(7438..7452),complement(8122..8286), ... FT BLASTN_HIT join(complement(61227..61633),complement(61756..61760), FT BLASTN_HIT complement(61316..61518) FT BLASTN_HIT complement(61227..61633) ... SQ Sequence 27479 BP; 6285 A; 7148 C; 7231 G; 5839 T; 976 other;
Het is duidelijk dat die BLASTN_HITS nog niet in de buurt komen om in die sequentie te vallen.
Twee mogelijke oplossingen: - Die BLASTN_HITS worden niet in de EMBL gestoken - Ik pas Artemini aan zodat features die niet binnen de sequentie passen, gewoon worden weggelaten.
groeten Thomas _______________________________________________ Beg-bogas mailing list Beg-bogas@psb.ugent.be https://maillist.psb.ugent.be/mailman/listinfo/beg-bogas
participants (1)
-
Thomas Abeel