something to consider for the revision and the future. tom -------- Original Message -------- Subject: Re: joint paper on SynTren and module network learning for BMC Bioinformatics Date: Tue, 10 Oct 2006 14:47:28 +0200 From: Tim Van den Bulcke <Tim.VandenBulcke@esat.kuleuven.be> To: tom.michoel@psb.ugent.be References: <4520DD47.7080902@psb.ugent.be> <4523D0F9.70209@esat.kuleuven.be> <452A5561.6000707@psb.ugent.be> [...]

...

P4: sensitivity, specificity, precision, recall:

misschien hebben we hier niet de gangbare termen gebruikt? jouw precision (tp/(tp+fp)) is wat wij specificity hebben genoemd; de definities staan in "Methods -> Network comparison", maar als dat niet de standaard benamingen zijn, kunnen we ze best aanpassen.

Ik denk dat dat niet de standaard benaming is. De definitie voor Specificity is TN/(FP+TN) [http://en.wikipedia.org/wiki/Sensitivity_and_specificity] en de precision = positive predictive value = tp/(tp+fp) [http://en.wikipedia.org/wiki/Information_retrieval#Precision] [...]