I put those scripts in the "java/timvdb" subdirectory of the segal project. Tom -------- Original Message -------- Subject: scripts etc Syntren Date: Fri, 07 Jul 2006 18:01:18 +0200 From: Tim Van den Bulcke <Tim.VandenBulcke@esat.kuleuven.be> To: tom.michoel@psb.ugent.be Hey Tom, hierbijgevoegd al de scripts die we overlopen hebben woensdag. Ik kon niet aan de gewijzigde genomica op de computercluster, dus ik zal Koen contacteren van zodra hij terug in Belgie is (maandag of dinsdag) daarvoor. De files: inference_Genomica_submitter.py zal jullie het meeste interesseren waarschijnlijk. Dit start een reeks genomica runs op de cluster. ./expressiondata/ bevat enkele scripts om expressiedata te genereren, misschien nog niet relevant op dit ogenblik, maar er zitten misschien een paar stukken code in die herbruikbaar zijn om dingen op een computercluster te draaien. in ./analyse/ zitten een reeks python scripts om data te verzamelen en te analyseren (ook om de output van genomica te converteren). Syntren zelf kan je afhalen op de website: http://homes.esat.kuleuven.be/~kmarchal/SynTReN/index.html Prettig weekend! Tim. -- _______________________________________________________ ir. Tim Van den Bulcke research assistant ESAT-SCD K.U. Leuven Kasteelpark Arenberg 10 B-3001 Leuven-Heverlee Belgium room: 03.11/14 tel: +32 16 32.86.43 fax: +32 16 32.19.70 email: tim.vandenbulcke@esat.kuleuven.be homepage: http://homes.esat.kuleuven.be/~vdbulcke/ personal homepage: http://timvandenbulcke.objectis.net _______________________________________________________