October 2010 - binari@psb.ugent.be - maillist.psb.ugent.be

[Binari] cluster shell
by Thomas Abeel 03 Nov '10

03 Nov '10

Wat is de shell op de cluster en hoe maak ik dat beest wijs dat ik bash wil? Scriptje: #!/bin/bash PREFIX="test" echo $PREFIX works fine op midas Maar op cluster krijg ik PREFIX=test: Command not found. PREFIX: Undefined variable. Wat erop wijst dat het daar tcsh is, wat ik vandaag eens niet wil. Any help? thanks, Thomas

4 6

[Binari] the 2010 darwin awards are here !
by Frederik Delaere 29 Oct '10

29 Oct '10

http://www.darwinawards.com/darwin/darwin2010.html Er bestaat trouwens een film hierover -- ================================================================== Frederik Delaere Tel:+32 (0)9 331 38 14 fax:+32 (0)9 3313809 VIB Department of Plant Systems Biology, Ghent University Technologiepark 927, 9052 Gent, BELGIUM frlae(a)psb.vib-ugent.be http://www.psb.vib-ugent.be ==================================================================

1 0

[Binari] toewijding
by Sofie Van Landeghem 27 Oct '10

27 Oct '10

Sommige mensen zijn echt extreem toegewijd aan hun job: -------- Original Message -------- Thank you for writing. I am on vacation Wednesday, Oct. 27. If you need a rapid reply, please call me at [blinded]. -- Sofie Van Landeghem PhD Student VIB Department of Plant Systems Biology, Ghent University Bioinformatics and Systems Biology Technologiepark 927, 9052 Gent, BELGIUM Tel: +32 (0)9 331 36 95 Website: http://bioinformatics.psb.ugent.be

3 2

[Binari] SW electronics shop
by Kenny Billiau 25 Oct '10

25 Oct '10

Made me laugh (and is prolly appropriate after this weekend's FACTS) http://io9.com/5671726/watch-c+3po-and-r2+d2-lose-their-minds-in-an-uk-elec… Kenny -- ====================================================================== Kenny Billiau Bioinformatics Group / GoFORSYS Scientific Programmer +49 331 567 8626 billiau(a)mpimp-golm.mpg.de Max Planck Institute for Molecular Plant Physiology Am Mühlenberg 1, 14476 Potsdam-Golm, Germany http://bioinformatics.mpimp-golm.mpg.de http://www.goforsys.de ======================================================================

1 0

[Binari] 90TB
by Kenny Billiau 22 Oct '10

22 Oct '10

Mssn kan IT wat storage bijeen hacken: http://basanovich.livejournal.com/163813.html (beetje scrollen voor de engelse versie) Kenny -- ====================================================================== Kenny Billiau Bioinformatics Group / GoFORSYS Scientific Programmer +49 331 567 8626 billiau(a)mpimp-golm.mpg.de Max Planck Institute for Molecular Plant Physiology Am Mühlenberg 1, 14476 Potsdam-Golm, Germany http://bioinformatics.mpimp-golm.mpg.de http://www.goforsys.de ======================================================================

3 8

[Binari] you've been rickrolled!
by Marijn Vandevoorde 22 Oct '10

22 Oct '10

http://gizmodo.com/5669317/student-hides-rick-astleys-song-in-college-paper

2 1

[Binari] caribbean heating
by Thomas Abeel 20 Oct '10

20 Oct '10

Is it just me or did someone just turn the heating to 'tropical' today?

4 3

[Binari] Processing
by Klaas Vandepoele 20 Oct '10

20 Oct '10

Privacy online; http://www.youtube.com/watch?v=rKhbUjVyKIc -- Klaas Vandepoele, PhD Tel. 32 (0)9 33 13822 VIB Department of Plant Systems Biology, Ghent University Technologiepark 927, 9052 Gent, Belgium E-mail: Klaas.Vandepoele(a)psb.vib-ugent.be Website: http://bioinformatics.psb.ugent.be/ --------------------------------------------------------- PLAZA, a resource for Plant Comparative Genomics http://bioinformatics.psb.ugent.be/plaza/ ---------------------------------------------------------

2 1

[Binari] guido gids
by Sofie Van Landeghem 19 Oct '10

19 Oct '10

Heeft toevallig er iemand één? Vanwaar haal je die eigenlijk? Vriendin heeft meegewerkt aan een artikel en is er nu naar op zoek, daarmee... Sofie

2 1

[Binari] Fwd: Re: default module
by Lieven Sterck 18 Oct '10

18 Oct '10

still completely bullet-proof ;-) -------- Original Message -------- Subject: Re: default module Date: Mon, 18 Oct 2010 14:01:12 +0200 From: Frederik Delaere <frlae(a)psb.vib-ugent.be> To: Lieven Sterck <lieven.sterck(a)psb.vib-ugent.be> heb net de test gedaan, en 1.9 krijgt de voorang op 1.1 en 1.10 1.09 daarintegen krijgt geen voorang :/ Lieven Sterck wrote: > wa gaat hij doen als je een versie .1 en .11 hebt -> > lexicographically gaat hij dan de versie .9 pakken nie? > > On 15/10/2010 11:39, Frederik Delaere wrote: >> module load java/$ARCH >> >> zal dan idd de hoogste versie nemen >> >> lieven: zet dat trouwens eens in de wiki als je wil :p >> >> lieven sterck wrote: >>> en wat als ge $ARCH gebruikt? gaat hij dan de hoogste versie nemen? >>> >>> L. >>> >>> On Fri, 15 Oct 2010 11:28:46 +0200, Frederik Delaere >>> <frlae(a)psb.vib-ugent.be> wrote: >>>> net wat zitten opzoeken: >>>> >>>> If no /default/ version may be figured out, then the highest >>>> lexicographically sorted /modulefile/ under the directory will be >>>> used. >>>> >>>> in het geval java bestaat de module directorystructuur er zo uit: >>>> >>>> >>>> >>>> /software/shared/modulefiles/java >>>> [frlae@midas java]$ tree >>>> . >>>> |-- i386 >>>> | |-- 1.5.0_19 >>>> | `-- 1.6.0_17 >>>> `-- x86_64 >>>> |-- 1.5.0_19 >>>> `-- 1.6.0_17 >>>> >>>> 2 directories, 4 files >>>> [frlae@midas java]$ >>>> >>>> dus als je module load java doet gaat hij de hoogst geplaceerde >>>> versie zoeken >>>> op midas (een 64bit systeem) gaat hij dus java 1.6 voor 64bit laden, >>> olé >>>> op een systeem dat 32bit is, gaat hij diezelfde versie laden, dus >>>> dat is >>> >>>> een probleem >>>> >>>> de manual spreekt ook van een manier omdat te overriden met config >>>> filekes, maar dat >>>> werkt totaal niet, maar ze zijn er dan ook niet echt duidelijk over >>> >> >> > -- ================================================================== Frederik Delaere Tel:+32 (0)9 331 38 14 fax:+32 (0)9 3313809 VIB Department of Plant Systems Biology, Ghent University Technologiepark 927, 9052 Gent, BELGIUM frlae(a)psb.vib-ugent.be http://www.psb.vib-ugent.be ==================================================================

1 0