
Blast gebruikt dat, maar lost volgens mij het probleem niet op. Meeste NGS dingen niet, net omdat het geen oplossing is. Disks zijn te traag vergeleken met memory. En hoewel het lijkt dat je applicatie loopt, is je runtime 10000 keer langer, wat meestal niet zo goed is. Het zou wel een oplossing zijn voor de perlgebruikers die volledige datasets in een hashmap willen lezen. cheers, T Frederik Delaere wrote:
as in, mss staat er iets in de manual van je geliefkoosde programmaatje dat daar naar wijst maar wist je tot daarnet niet wat het betekende !
:p
Lieven Sterck wrote:
well IT ... you tell me ;-)
On 16/07/2010 10:58, Frederik Delaere wrote:
http://en.wikipedia.org/wiki/Mmap
is er een optie om bvb in blast hier gebruik van te maken ? lost direct het probleem op dat de clusternodes te weinig mem hebben ?
idem voor die NGS dingen