egrep?


Thomas Abeel wrote:
nope, doet ook niets

Sofie Van Landeghem wrote:
  
moet je niet -e doen voor reg.exp?
Thomas Abeel wrote:
  
    
        
Ik heb een file waar vaak 'mRNA:     ' in voorkomt (mRNA: met een aantal 
spaties achter.

Nu wil grep/sed niet doen wat ik wil.

grep 'mRNA: ' scaffold_1.gff3 geeft output
grep 'mRNA: +' scaffold_1.gff3 geeft geen output.
grep 'mRNA:[ ]+' scaffold_1.gff3 geeft ook geen output.


Any ideas why?

thanks,
Thomas
_______________________________________________
Binari Implicitly Neglects All Recursive Iterations
https://maillist.psb.ugent.be/mailman/listinfo/binari
  
    
      
          
  
    
        
  
      
-- 
Sofie Van Landeghem
PhD Student
VIB Department of Plant Systems Biology, Ghent University
Bioinformatics and Systems Biology
Technologiepark 927, 9052 Gent, BELGIUM
Tel: +32 (0)9 331 36 95
Website: http://bioinformatics.psb.ugent.be  


------------------------------------------------------------------------

_______________________________________________
Binari Implicitly Neglects All Recursive Iterations
https://maillist.psb.ugent.be/mailman/listinfo/binari
    
_______________________________________________
Binari Implicitly Neglects All Recursive Iterations
https://maillist.psb.ugent.be/mailman/listinfo/binari
  

-- 
Sofie Van Landeghem
PhD Student
VIB Department of Plant Systems Biology, Ghent University
Bioinformatics and Systems Biology
Technologiepark 927, 9052 Gent, BELGIUM
Tel: +32 (0)9 331 36 95
Website: http://bioinformatics.psb.ugent.be