[Binari] slightly obnoxious midas

Suppose you're currently in a certain directory, you delete the directory from outside the console and create it back, then do "ls" and you get "ls: .: Stale NFS file handle" Funny thing is, doing "cd ../dirname" does work :-) Slightly stupid, no? Sofie -- Sofie Van Landeghem PhD Student VIB Department of Plant Systems Biology, Ghent University Bioinformatics and Systems Biology Technologiepark 927, 9052 Gent, BELGIUM Tel: +32 (0)9 331 36 95 Website: http://bioinformatics.psb.ugent.be

ik denk dat dit de reden is : dat je huidige dir een andere inode heeft dan de nieuwe dir, alhoewel de naam hetzelfde is http://en.wikipedia.org/wiki/Inode Sofie Van Landeghem wrote:
Suppose you're currently in a certain directory, you delete the directory from outside the console and create it back, then do "ls" and you get "ls: .: Stale NFS file handle" Funny thing is, doing "cd ../dirname" does work :-) Slightly stupid, no?
Sofie
-- ================================================================== Frederik Delaere Tel:+32 (0)9 331 38 14 fax:+32 (0)9 3313809 VIB Department of Plant Systems Biology, Ghent University Technologiepark 927, 9052 Gent, BELGIUM frlae@psb.vib-ugent.be http://www.psb.vib-ugent.be ==================================================================

mja oké, maar het vreemde is dat hij wel het path nog weet, want hij weet waar "cd" naar toe moet... kan die dan nie gewoon erkennen dat er een nieuwe dir is met dezelfde naam en gewoon braaf daar in gaan staan :p Sofie Frederik Delaere wrote:
ik denk dat dit de reden is :
dat je huidige dir een andere inode heeft dan de nieuwe dir, alhoewel de naam hetzelfde is
http://en.wikipedia.org/wiki/Inode
Sofie Van Landeghem wrote:
Suppose you're currently in a certain directory, you delete the directory from outside the console and create it back, then do "ls" and you get "ls: .: Stale NFS file handle" Funny thing is, doing "cd ../dirname" does work :-) Slightly stupid, no?
Sofie
-- Sofie Van Landeghem PhD Student VIB Department of Plant Systems Biology, Ghent University Bioinformatics and Systems Biology Technologiepark 927, 9052 Gent, BELGIUM Tel: +32 (0)9 331 36 95 Website: http://bioinformatics.psb.ugent.be

computer says noooooo On 11/16/2010 10:38 AM, Sofie Van Landeghem wrote:
mja oké, maar het vreemde is dat hij wel het path nog weet, want hij weet waar "cd" naar toe moet... kan die dan nie gewoon erkennen dat er een nieuwe dir is met dezelfde naam en gewoon braaf daar in gaan staan :p
Sofie
Frederik Delaere wrote:
ik denk dat dit de reden is :
dat je huidige dir een andere inode heeft dan de nieuwe dir, alhoewel de naam hetzelfde is
http://en.wikipedia.org/wiki/Inode
Sofie Van Landeghem wrote:
Suppose you're currently in a certain directory, you delete the directory from outside the console and create it back, then do "ls" and you get "ls: .: Stale NFS file handle" Funny thing is, doing "cd ../dirname" does work :-) Slightly stupid, no?
Sofie
-- Sofie Van Landeghem PhD Student VIB Department of Plant Systems Biology, Ghent University Bioinformatics and Systems Biology Technologiepark 927, 9052 Gent, BELGIUM Tel: +32 (0)9 331 36 95 Website: http://bioinformatics.psb.ugent.be
_______________________________________________ Binari Implicitly Neglects All Recursive Iterations https://maillist.psb.ugent.be/mailman/listinfo/binari
-- ================================================================== Marijn Vandevoorde Tel:+32 (0)9 331 36 95 fax:+32 (0)9 3313809 VIB Department of Plant Systems Biology, Ghent University Technologiepark 927, 9052 Gent, BELGIUM mavoo@psb.vib-ugent.be http://www.psb.vib-ugent.be ==================================================================

Wel, de dir '..' wijst wel nog naar de inode vande onderliggende dir, dus 'cd ../dirnaam' werkt. Kenny On Tue, 16 Nov 2010, Sofie Van Landeghem wrote:
mja oké, maar het vreemde is dat hij wel het path nog weet, want hij weet waar "cd" naar toe moet... kan die dan nie gewoon erkennen dat er een nieuwe dir is met dezelfde naam en gewoon braaf daar in gaan staan :p
Sofie
Frederik Delaere wrote:
ik denk dat dit de reden is :
dat je huidige dir een andere inode heeft dan de nieuwe dir, alhoewel de naam hetzelfde is
http://en.wikipedia.org/wiki/Inode
Sofie Van Landeghem wrote:
Suppose you're currently in a certain directory, you delete the directory from outside the console and create it back, then do "ls" and you get "ls: .: Stale NFS file handle" Funny thing is, doing "cd ../dirname" does work :-) Slightly stupid, no?
Sofie
-- ====================================================================== Kenny Billiau Bioinformatics Group / GoFORSYS Scientific Programmer +49 331 567 8626 billiau@mpimp-golm.mpg.de Max Planck Institute for Molecular Plant Physiology Am Mühlenberg 1, 14476 Potsdam-Golm, Germany http://bioinformatics.mpimp-golm.mpg.de http://www.goforsys.de ======================================================================

Ok, ik wil hier niet over blíjven doorbomen, maar soms is het toch echt maar raar hoor : [solan@midas binary]$ ls PMID-10089566.rel PMID-10403270.rel PMID-1740663.rel PMID-7537762.rel PMID-8106512.rel PMID-8622948.rel PMID-8913871.rel PMID-9234696.rel [solan@midas binary]$ pwd /group/biocomp/users/solan/bionlp11/REL/runs/unary/1.unaryfeatures_fs_binary/preds/binary_bugfix [solan@midas binary]$ cd .. [solan@midas preds]$ cd binary [solan@midas binary]$ ls [solan@midas binary]$ tussen de commando's werd nergens extern iets veranderd :) deze keer was hij dus automatisch van dir veranderd na de hernoeming (extern gebeurd), maar de nieuwe naam wel niet getoond in de console... 't is een beetje roulette. achja. Sofie Kenny Billiau wrote:
Wel,
de dir '..' wijst wel nog naar de inode vande onderliggende dir, dus 'cd ../dirnaam' werkt.
Kenny
On Tue, 16 Nov 2010, Sofie Van Landeghem wrote:
mja oké, maar het vreemde is dat hij wel het path nog weet, want hij weet waar "cd" naar toe moet... kan die dan nie gewoon erkennen dat er een nieuwe dir is met dezelfde naam en gewoon braaf daar in gaan staan :p
Sofie
Frederik Delaere wrote:
ik denk dat dit de reden is :
dat je huidige dir een andere inode heeft dan de nieuwe dir, alhoewel de naam hetzelfde is
http://en.wikipedia.org/wiki/Inode
Sofie Van Landeghem wrote:
Suppose you're currently in a certain directory, you delete the directory from outside the console and create it back, then do "ls" and you get "ls: .: Stale NFS file handle" Funny thing is, doing "cd ../dirname" does work :-) Slightly stupid, no?
Sofie
-- ====================================================================== Kenny Billiau Bioinformatics Group / GoFORSYS Scientific Programmer +49 331 567 8626 billiau@mpimp-golm.mpg.de Max Planck Institute for Molecular Plant Physiology Am Mühlenberg 1, 14476 Potsdam-Golm, Germany http://bioinformatics.mpimp-golm.mpg.de http://www.goforsys.de ====================================================================== ------------------------------------------------------------------------
_______________________________________________ Binari Implicitly Neglects All Recursive Iterations https://maillist.psb.ugent.be/mailman/listinfo/binari
-- Sofie Van Landeghem PhD Student VIB Department of Plant Systems Biology, Ghent University Bioinformatics and Systems Biology Technologiepark 927, 9052 Gent, BELGIUM Tel: +32 (0)9 331 36 95 Website: http://bioinformatics.psb.ugent.be

las ik nu net 'niet doordrammen' :-P k On 16/11/2010 16:17, Sofie Van Landeghem wrote:
Ok, ik wil hier niet over blíjven doorbomen, maar soms is het toch echt maar raar hoor :
[solan@midas binary]$ ls PMID-10089566.rel PMID-10403270.rel PMID-1740663.rel PMID-7537762.rel PMID-8106512.rel PMID-8622948.rel PMID-8913871.rel PMID-9234696.rel [solan@midas binary]$ pwd /group/biocomp/users/solan/bionlp11/REL/runs/unary/1.unaryfeatures_fs_binary/preds/binary_bugfix [solan@midas binary]$ cd .. [solan@midas preds]$ cd binary [solan@midas binary]$ ls [solan@midas binary]$
tussen de commando's werd nergens extern iets veranderd :) deze keer was hij dus automatisch van dir veranderd na de hernoeming (extern gebeurd), maar de nieuwe naam wel niet getoond in de console... 't is een beetje roulette.
achja.
Sofie
Kenny Billiau wrote:
Wel,
de dir '..' wijst wel nog naar de inode vande onderliggende dir, dus 'cd ../dirnaam' werkt.
Kenny
On Tue, 16 Nov 2010, Sofie Van Landeghem wrote:
mja oké, maar het vreemde is dat hij wel het path nog weet, want hij weet waar "cd" naar toe moet... kan die dan nie gewoon erkennen dat er een nieuwe dir is met dezelfde naam en gewoon braaf daar in gaan staan :p
Sofie
Frederik Delaere wrote:
ik denk dat dit de reden is :
dat je huidige dir een andere inode heeft dan de nieuwe dir, alhoewel de naam hetzelfde is
http://en.wikipedia.org/wiki/Inode
Sofie Van Landeghem wrote:
Suppose you're currently in a certain directory, you delete the directory from outside the console and create it back, then do "ls" and you get "ls: .: Stale NFS file handle" Funny thing is, doing "cd ../dirname" does work :-) Slightly stupid, no?
Sofie
-- ====================================================================== Kenny Billiau Bioinformatics Group / GoFORSYS Scientific Programmer +49 331 567 8626 billiau@mpimp-golm.mpg.de Max Planck Institute for Molecular Plant Physiology Am Mühlenberg 1, 14476 Potsdam-Golm, Germany http://bioinformatics.mpimp-golm.mpg.de http://www.goforsys.de ====================================================================== ------------------------------------------------------------------------
_______________________________________________ Binari Implicitly Neglects All Recursive Iterations https://maillist.psb.ugent.be/mailman/listinfo/binari
-- Sofie Van Landeghem PhD Student VIB Department of Plant Systems Biology, Ghent University Bioinformatics and Systems Biology Technologiepark 927, 9052 Gent, BELGIUM Tel: +32 (0)9 331 36 95 Website:http://bioinformatics.psb.ugent.be
_______________________________________________ Binari Implicitly Neglects All Recursive Iterations https://maillist.psb.ugent.be/mailman/listinfo/binari
-- Klaas Vandepoele, PhD Tel. 32 (0)9 33 13822 VIB Department of Plant Systems Biology, Ghent University Technologiepark 927, 9052 Gent, Belgium E-mail: Klaas.Vandepoele@psb.vib-ugent.be Website: http://bioinformatics.psb.ugent.be/ --------------------------------------------------------- PLAZA, a resource for Plant Comparative Genomics http://bioinformatics.psb.ugent.be/plaza/ ---------------------------------------------------------

nee, "doorbomen" :) Klaas Vandepoele wrote:
las ik nu net 'niet doordrammen' :-P
k
On 16/11/2010 16:17, Sofie Van Landeghem wrote:
Ok, ik wil hier niet over blíjven doorbomen, maar soms is het toch echt maar raar hoor :
[solan@midas binary]$ ls PMID-10089566.rel PMID-10403270.rel PMID-1740663.rel PMID-7537762.rel PMID-8106512.rel PMID-8622948.rel PMID-8913871.rel PMID-9234696.rel [solan@midas binary]$ pwd /group/biocomp/users/solan/bionlp11/REL/runs/unary/1.unaryfeatures_fs_binary/preds/binary_bugfix [solan@midas binary]$ cd .. [solan@midas preds]$ cd binary [solan@midas binary]$ ls [solan@midas binary]$
tussen de commando's werd nergens extern iets veranderd :) deze keer was hij dus automatisch van dir veranderd na de hernoeming (extern gebeurd), maar de nieuwe naam wel niet getoond in de console... 't is een beetje roulette.
achja.
Sofie
Kenny Billiau wrote:
Wel,
de dir '..' wijst wel nog naar de inode vande onderliggende dir, dus 'cd ../dirnaam' werkt.
Kenny
On Tue, 16 Nov 2010, Sofie Van Landeghem wrote:
mja oké, maar het vreemde is dat hij wel het path nog weet, want hij weet waar "cd" naar toe moet... kan die dan nie gewoon erkennen dat er een nieuwe dir is met dezelfde naam en gewoon braaf daar in gaan staan :p
Sofie
Frederik Delaere wrote:
ik denk dat dit de reden is :
dat je huidige dir een andere inode heeft dan de nieuwe dir, alhoewel de naam hetzelfde is
http://en.wikipedia.org/wiki/Inode
Sofie Van Landeghem wrote:
Suppose you're currently in a certain directory, you delete the directory from outside the console and create it back, then do "ls" and you get "ls: .: Stale NFS file handle" Funny thing is, doing "cd ../dirname" does work :-) Slightly stupid, no?
Sofie
-- ====================================================================== Kenny Billiau Bioinformatics Group / GoFORSYS Scientific Programmer +49 331 567 8626 billiau@mpimp-golm.mpg.de Max Planck Institute for Molecular Plant Physiology Am Mühlenberg 1, 14476 Potsdam-Golm, Germany http://bioinformatics.mpimp-golm.mpg.de http://www.goforsys.de ====================================================================== ------------------------------------------------------------------------
_______________________________________________ Binari Implicitly Neglects All Recursive Iterations https://maillist.psb.ugent.be/mailman/listinfo/binari
-- Sofie Van Landeghem PhD Student VIB Department of Plant Systems Biology, Ghent University Bioinformatics and Systems Biology Technologiepark 927, 9052 Gent, BELGIUM Tel: +32 (0)9 331 36 95 Website: http://bioinformatics.psb.ugent.be
_______________________________________________ Binari Implicitly Neglects All Recursive Iterations https://maillist.psb.ugent.be/mailman/listinfo/binari
--
Klaas Vandepoele, PhD Tel. 32 (0)9 33 13822 VIB Department of Plant Systems Biology, Ghent University Technologiepark 927, 9052 Gent, Belgium E-mail: Klaas.Vandepoele@psb.vib-ugent.be Website: http://bioinformatics.psb.ugent.be/ --------------------------------------------------------- PLAZA, a resource for Plant Comparative Genomics http://bioinformatics.psb.ugent.be/plaza/ ---------------------------------------------------------
------------------------------------------------------------------------
_______________________________________________ Binari Implicitly Neglects All Recursive Iterations https://maillist.psb.ugent.be/mailman/listinfo/binari
-- Sofie Van Landeghem PhD Student VIB Department of Plant Systems Biology, Ghent University Bioinformatics and Systems Biology Technologiepark 927, 9052 Gent, BELGIUM Tel: +32 (0)9 331 36 95 Website: http://bioinformatics.psb.ugent.be

Euhm .. je cwd was 'binary_bugfix' en niet 'binary' .. On Tue, 16 Nov 2010, Sofie Van Landeghem wrote:
Ok, ik wil hier niet over blíjven doorbomen, maar soms is het toch echt maar raar hoor :
[solan@midas binary]$ ls PMID-10089566.rel PMID-10403270.rel PMID-1740663.rel PMID-7537762.rel PMID-8106512.rel PMID-8622948.rel PMID-8913871.rel PMID-9234696.rel [solan@midas binary]$ pwd /group/biocomp/users/solan/bionlp11/REL/runs/unary/1.unaryfeatures_fs_binary/preds/binary_bugfix [solan@midas binary]$ cd .. [solan@midas preds]$ cd binary [solan@midas binary]$ ls [solan@midas binary]$
tussen de commando's werd nergens extern iets veranderd :) deze keer was hij dus automatisch van dir veranderd na de hernoeming (extern gebeurd), maar de nieuwe naam wel niet getoond in de console... 't is een beetje roulette.
achja.
Sofie
Kenny Billiau wrote: Wel,
de dir '..' wijst wel nog naar de inode vande onderliggende dir, dus 'cd ../dirnaam' werkt.
Kenny
On Tue, 16 Nov 2010, Sofie Van Landeghem wrote:
mja oké, maar het vreemde is dat hij wel het path nog weet, want hij weet waar "cd" naar toe moet... kan die dan nie gewoon erkennen dat er een nieuwe dir is met dezelfde naam en gewoon braaf daar in gaan staan :p
Sofie
Frederik Delaere wrote:
ik denk dat dit de reden is :
dat je huidige dir een andere inode heeft dan de nieuwe dir, alhoewel de naam hetzelfde is
http://en.wikipedia.org/wiki/Inode
Sofie Van Landeghem wrote:
Suppose you're currently in a certain directory, you delete the directory from outside the console and create it back, then do "ls" and you get "ls: .: Stale NFS file handle" Funny thing is, doing "cd ../dirname" does work :-) Slightly stupid, no?
Sofie
-- ====================================================================== Kenny Billiau Bioinformatics Group / GoFORSYS Scientific Programmer +49 331 567 8626 billiau@mpimp-golm.mpg.de<mailto:billiau@mpimp-golm.mpg.de> Max Planck Institute for Molecular Plant Physiology Am Mühlenberg 1, 14476 Potsdam-Golm, Germany http://bioinformatics.mpimp-golm.mpg.de http://www.goforsys.de ======================================================================
________________________________
_______________________________________________ Binari Implicitly Neglects All Recursive Iterations https://maillist.psb.ugent.be/mailman/listinfo/binari
-- Sofie Van Landeghem PhD Student VIB Department of Plant Systems Biology, Ghent University Bioinformatics and Systems Biology Technologiepark 927, 9052 Gent, BELGIUM Tel: +32 (0)9 331 36 95 Website: http://bioinformatics.psb.ugent.be
-- ====================================================================== Kenny Billiau Bioinformatics Group / GoFORSYS Scientific Programmer +49 331 567 8626 billiau@mpimp-golm.mpg.de Max Planck Institute for Molecular Plant Physiology Am Mühlenberg 1, 14476 Potsdam-Golm, Germany http://bioinformatics.mpimp-golm.mpg.de http://www.goforsys.de ======================================================================
participants (5)
-
Frederik Delaere
-
Kenny Billiau
-
Klaas Vandepoele
-
Marijn Vandevoorde
-
Sofie Van Landeghem