Wat is de shell op de cluster en hoe maak ik dat beest wijs dat ik bash wil? Scriptje: #!/bin/bash PREFIX="test" echo $PREFIX works fine op midas Maar op cluster krijg ik PREFIX=test: Command not found. PREFIX: Undefined variable. Wat erop wijst dat het daar tcsh is, wat ik vandaag eens niet wil. Any help? thanks, Thomas
het is inderdaad tcsh je submit script moet tcsh zijn, maar niets belet je om daar in te zetten sh <myotherscript.sh> Thomas Abeel wrote:
Wat is de shell op de cluster en hoe maak ik dat beest wijs dat ik bash wil?
Scriptje:
#!/bin/bash PREFIX="test" echo $PREFIX
works fine op midas
Maar op cluster krijg ik PREFIX=test: Command not found. PREFIX: Undefined variable.
Wat erop wijst dat het daar tcsh is, wat ik vandaag eens niet wil.
Any help?
thanks, Thomas _______________________________________________ Binari Implicitly Neglects All Recursive Iterations https://maillist.psb.ugent.be/mailman/listinfo/binari
-- ================================================================== Frederik Delaere Tel:+32 (0)9 331 38 14 fax:+32 (0)9 3313809 VIB Department of Plant Systems Biology, Ghent University Technologiepark 927, 9052 Gent, BELGIUM frlae@psb.vib-ugent.be http://www.psb.vib-ugent.be ==================================================================
Hoe set ik een variabele in tcsh? On 29/10/2010 11:38, Frederik Delaere wrote:
het is inderdaad tcsh
je submit script moet tcsh zijn, maar niets belet je om daar in te zetten
sh<myotherscript.sh>
Thomas Abeel wrote:
Wat is de shell op de cluster en hoe maak ik dat beest wijs dat ik bash wil?
Scriptje:
#!/bin/bash PREFIX="test" echo $PREFIX
works fine op midas
Maar op cluster krijg ik PREFIX=test: Command not found. PREFIX: Undefined variable.
Wat erop wijst dat het daar tcsh is, wat ik vandaag eens niet wil.
Any help?
thanks, Thomas _______________________________________________ Binari Implicitly Neglects All Recursive Iterations https://maillist.psb.ugent.be/mailman/listinfo/binari
set var blablalbla ? On Fri, 29 Oct 2010 12:56:08 +0200, Thomas Abeel <thomas@abeel.be> wrote:
Hoe set ik een variabele in tcsh?
On 29/10/2010 11:38, Frederik Delaere wrote:
het is inderdaad tcsh
je submit script moet tcsh zijn, maar niets belet je om daar in te zetten
sh<myotherscript.sh>
Thomas Abeel wrote:
Wat is de shell op de cluster en hoe maak ik dat beest wijs dat ik bash wil?
Scriptje:
#!/bin/bash PREFIX="test" echo $PREFIX
works fine op midas
Maar op cluster krijg ik PREFIX=test: Command not found. PREFIX: Undefined variable.
Wat erop wijst dat het daar tcsh is, wat ik vandaag eens niet wil.
Any help?
thanks, Thomas _______________________________________________ Binari Implicitly Neglects All Recursive Iterations https://maillist.psb.ugent.be/mailman/listinfo/binari
_______________________________________________ Binari Implicitly Neglects All Recursive Iterations https://maillist.psb.ugent.be/mailman/listinfo/binari
-- ============================================================== Lieven Sterck, PhD Tel:+32 (0)9 3313821 Fax:+32 (0)9 3313809 VIB Department of Plant Systems Biology, UGent Bioinformatics and Evolutionary Genomics Division Technologiepark 927, B-9052 Gent, Belgium Email: lieven.sterck@psb.vib-ugent.be Website: http://bioinformatics.psb.ugent.be ============================================================== "Facts are meaningless. You could use facts to prove anything that's even remotely true" - H. Simpson
setenv BLAH "blaat" Thomas Abeel wrote:
Hoe set ik een variabele in tcsh?
On 29/10/2010 11:38, Frederik Delaere wrote:
het is inderdaad tcsh
je submit script moet tcsh zijn, maar niets belet je om daar in te zetten
sh<myotherscript.sh>
Thomas Abeel wrote:
Wat is de shell op de cluster en hoe maak ik dat beest wijs dat ik bash wil?
Scriptje:
#!/bin/bash PREFIX="test" echo $PREFIX
works fine op midas
Maar op cluster krijg ik PREFIX=test: Command not found. PREFIX: Undefined variable.
Wat erop wijst dat het daar tcsh is, wat ik vandaag eens niet wil.
Any help?
thanks, Thomas _______________________________________________ Binari Implicitly Neglects All Recursive Iterations https://maillist.psb.ugent.be/mailman/listinfo/binari
_______________________________________________ Binari Implicitly Neglects All Recursive Iterations https://maillist.psb.ugent.be/mailman/listinfo/binari
-- ================================================================== Frederik Delaere Tel:+32 (0)9 331 38 14 fax:+32 (0)9 3313809 VIB Department of Plant Systems Biology, Ghent University Technologiepark 927, 9052 Gent, BELGIUM frlae@psb.vib-ugent.be http://www.psb.vib-ugent.be ==================================================================
Wow. Bijna even snel als google ;) On Wed, 3 Nov 2010, Frederik Delaere wrote:
setenv BLAH "blaat"
Thomas Abeel wrote:
Hoe set ik een variabele in tcsh?
On 29/10/2010 11:38, Frederik Delaere wrote:
het is inderdaad tcsh
je submit script moet tcsh zijn, maar niets belet je om daar in te zetten
sh<myotherscript.sh>
Thomas Abeel wrote:
Wat is de shell op de cluster en hoe maak ik dat beest wijs dat ik bash wil?
Scriptje:
#!/bin/bash PREFIX="test" echo $PREFIX
works fine op midas
Maar op cluster krijg ik PREFIX=test: Command not found. PREFIX: Undefined variable.
Wat erop wijst dat het daar tcsh is, wat ik vandaag eens niet wil.
Any help?
thanks, Thomas _______________________________________________ Binari Implicitly Neglects All Recursive Iterations https://maillist.psb.ugent.be/mailman/listinfo/binari
_______________________________________________ Binari Implicitly Neglects All Recursive Iterations https://maillist.psb.ugent.be/mailman/listinfo/binari
-- ====================================================================== Kenny Billiau Bioinformatics Group / GoFORSYS Scientific Programmer +49 331 567 8626 billiau@mpimp-golm.mpg.de Max Planck Institute for Molecular Plant Physiology Am Mühlenberg 1, 14476 Potsdam-Golm, Germany http://bioinformatics.mpimp-golm.mpg.de http://www.goforsys.de ======================================================================
't is door het winter uur hé ;) Kenny Billiau wrote:
Wow. Bijna even snel als google ;)
On Wed, 3 Nov 2010, Frederik Delaere wrote:
setenv BLAH "blaat"
Thomas Abeel wrote:
Hoe set ik een variabele in tcsh?
On 29/10/2010 11:38, Frederik Delaere wrote:
het is inderdaad tcsh
je submit script moet tcsh zijn, maar niets belet je om daar in te zetten
sh<myotherscript.sh>
Thomas Abeel wrote:
Wat is de shell op de cluster en hoe maak ik dat beest wijs dat ik bash wil?
Scriptje:
#!/bin/bash PREFIX="test" echo $PREFIX
works fine op midas
Maar op cluster krijg ik PREFIX=test: Command not found. PREFIX: Undefined variable.
Wat erop wijst dat het daar tcsh is, wat ik vandaag eens niet wil.
Any help?
thanks, Thomas _______________________________________________ Binari Implicitly Neglects All Recursive Iterations https://maillist.psb.ugent.be/mailman/listinfo/binari
_______________________________________________ Binari Implicitly Neglects All Recursive Iterations https://maillist.psb.ugent.be/mailman/listinfo/binari
-- ====================================================================== Kenny Billiau Bioinformatics Group / GoFORSYS Scientific Programmer +49 331 567 8626 billiau@mpimp-golm.mpg.de Max Planck Institute for Molecular Plant Physiology Am Mühlenberg 1, 14476 Potsdam-Golm, Germany http://bioinformatics.mpimp-golm.mpg.de http://www.goforsys.de ====================================================================== ------------------------------------------------------------------------
_______________________________________________ Binari Implicitly Neglects All Recursive Iterations https://maillist.psb.ugent.be/mailman/listinfo/binari
-- ================================================================== Frederik Delaere Tel:+32 (0)9 331 38 14 fax:+32 (0)9 3313809 VIB Department of Plant Systems Biology, Ghent University Technologiepark 927, 9052 Gent, BELGIUM frlae@psb.vib-ugent.be http://www.psb.vib-ugent.be ==================================================================
participants (4)
-
Frederik Delaere -
Kenny Billiau -
lieven sterck -
Thomas Abeel