[BBC] Vacancy bioinformatician / software engineer VUmc Amsterdam The Netherlands

[Sie, Daud]

Dear all,

The Clinical Genetics department at the VUmc Amsterdam  is looking for a bioinformatician / software engineer:

https://www.werkenbijvumc.nl/vacatures/bioinformaticus-software-engineer/

The following job description is in Dutch. If you would like to know more please contact Daphne van Beek (e: d.vanbeek at vumc.nl or p: +31204444435)

Job description (Dutch):

====

Werkomgeving:

Het laboratorium genoomdiagnostiek is verantwoordelijk voor de diagnostiek van patiëntmateriaal bij (mogelijke) genetische/erfelijke afwijkingen. Innovatie is voor ons heel belangrijk en we doen veel aan technologische ontwikkeling, vaak in (inter)nationale samenwerkingen. Er wordt naast traditionele methoden veel gebruik gemaakt van Next Generation Sequencing dat 'big data' genereert. Voor alle processen op het lab is het belangrijk dat de diagnostiek geborgd wordt door een goede soft- en hardware infrastructuur, versiebeheer en onderhoud.

Werkzaamheden:

Als Bioinformaticus/Software Engineer zijn je voornaamste taken en verantwoordelijkheden:
. Ontwikkelen, valideren en implementeren van nieuwe bioinformatische tools in de diagnostiek;
. Ondersteunen van programmering robots op het lab;
. Faciliteren van diagnostiek productie (o.a. runnen van pipelines, troubleshooten);
. Internationaal beschikbaar maken van verschillende grote datasets (data ontsluiten);
. Optimaliseren van de diagnostische workflow (o.a. door te automatiseren);
. Uitvoeren van periodieke checks en het genereren van statistieken;
. Versiebeheer van zowel soft- als hardware.

Jouw profiel:

. Afgeronde WO opleiding (bio)informatica of een afgeronde HBO opleiding (bio)informatica met bij voorkeur relevante werkervaring;
. Ervaring met het ontwikkelen/runnen/onderhouden van een (automatiserings) pipeline;
. Kennis van en ervaring met Python en bash in een Linux omgeving;
. Ervaring met het werken met HPC is een pré;
. Ervaring in de bioinformatica/genetica is niet nodig, interesse hierin is echter wenselijk;
. Goede communicatievaardigheden.

Daarnaast ben je analytisch sterk, inventief in het vinden van passende oplossingen, stressbestendig en neem je initiatief.

Interesse?

Wil je meer informatie over de functie dan kun je contact opnemen met mw. D. van Beek, bio-informaticus via 0204443092 of met R.van Latum via 0204444435. Je kunt uiterlijk tot en met 29 november 2016 solliciteren.

====

Kind regards,
 
Daoud Sie, MSc
Coordinator Genomics Research Facility
VU University Medical Center Amsterdam - department of Pathology
E: d.sie at vumc.nl
P: +31204442428
 
Present: Mon/Tue/Wed/Fri

De Boelelaan CCA-1.08, 1081 HV Amsterdam
 
Mailing adress: Postbus 7057, 1007 MB Amsterdam

www.vumc.com 
www.vumc.com/directions  
---------------------------------------------------
Disclaimer
This e-mail is confidential and may contain information that is not intended for you. If you are not the addressee or if this message was sent to you by mistake, you are requested to inform the sender and delete the message. VU University Medical Center accepts no liability for damage of any kind resulting from the risks inherent in the electronic transmission of messages.
---------------------------------------------------