January 2008 - BBClist - maillist.psb.ugent.be

Gene Golub Around the World Day - Leuven, Feb. 29, 2008, , 09:00 - 17:00 hrs
by Ida Tassens 25 Jan '08

25 Jan '08

We apologize if you would receive this mail several times. Dear, ESAT/SCD (EE Dept, K.U.Leuven) and CESAME (Universite Catholique de Louvain) organize an event in memory of Gene Golub in Leuven. The event is part of the Gene Golub Around the World Day (29th February, Gene Golub's birthday - see http://www.cs.nyu.edu/overton/ genearoundtheworld/). More information: http://www.kuleuven.be/golub/ (the website will be updated as soon as all information is available). A tentative list of speakers: - Raf Vandebril, K.U.Leuven, Dept. of Computer Science - Bo Kågström, Umea Univ., Dept. Computing Science - Gregory Boutry (Univ. Catholique de Lille, Faculte Libre des Sciences et Technologies) - Martin H. Gutknecht, ETH Zurich, Applied Mathematics - Claude Brezinski, Univ. des Sciences et Technologies de Lille - Alistair Watson, Univ. Dundee, Div. Mathematics - Annie Cuyt, Univ. Antwerpen, Dept. Mathematics and Computer Science - Diana Sima, K.U.Leuven, EE Dept. (ESAT/SCD) - Lieven De Lathauwer, EE Dept. (ESAT/SCD) - Petter Bjørstad, University of Bergen, Applied and Computational Mathematics Group. (not yet confirmed) - Paul Van Dooren, UCL, CESAME - Sabine Van Huffel, K.U.Leuven, EE Dept. (ESAT/SCD) - Bart De Moor, K.U.Leuven, EE Dept. (ESAT/SCD) The talks will have the right mix of technical contribution and fond memories of Gene Golub. The event will be followed by a dinner in a Chinese restaurant. Registration, coffee breaks and sandwich lunch are free of charge. The dinner will cost 40 euro. Please register on the website (http://www.kuleuven.be/golub/ ) before Feb. 15, and indicate if you will attend the dinner (please fill out the Dinner Registration Form). All practical details can be found on the website (payment details, hotel information, final program, ...): http://www.kuleuven.be/golub/ . We hope to welcome you at this event, Bart De Moor, Paul Van Dooren, Sabine Van Huffel Disclaimer: http://www.kuleuven.be/cwis/email_disclaimer.htm -- Ida Tassens K.U.Leuven, ESAT/SCD (SISTA) Kasteelpark Arenberg 10 B-3001 Leuven, Belgium Tel. +32/16/32.17.09 Fax. +32/16/32.19.70 ida.tassens(a)esat.kuleuven.be -- Ida Tassens K.U.Leuven, ESAT/SCD (SISTA) Kasteelpark Arenberg 10 B-3001 Leuven, Belgium Tel. +32/16/32.17.09 Fax. +32/16/32.19.70 ida.tassens(a)esat.kuleuven.be -- Ida Tassens K.U.Leuven, ESAT/SCD (SISTA) Kasteelpark Arenberg 10 B-3001 Leuven, Belgium Tel. +32/16/32.17.09 Fax. +32/16/32.19.70 ida.tassens(a)esat.kuleuven.be -- Ida Tassens K.U.Leuven, ESAT/SCD (SISTA) Kasteelpark Arenberg 10 B-3001 Leuven, Belgium Tel. +32/16/32.17.09 Fax. +32/16/32.19.70 ida.tassens(a)esat.kuleuven.be -- Ida Tassens K.U.Leuven, ESAT/SCD (SISTA) Kasteelpark Arenberg 10 B-3001 Leuven, Belgium Tel. +32/16/32.17.09 Fax. +32/16/32.19.70 ida.tassens(a)esat.kuleuven.be -- Ida Tassens K.U.Leuven, ESAT/SCD (SISTA) Kasteelpark Arenberg 10 B-3001 Leuven, Belgium Tel. +32/16/32.17.09 Fax. +32/16/32.19.70 ida.tassens(a)esat.kuleuven.be -- Ida Tassens K.U.Leuven, ESAT/SCD (SISTA) Kasteelpark Arenberg 10 B-3001 Leuven, Belgium Tel. +32/16/32.17.09 Fax. +32/16/32.19.70 ida.tassens(a)esat.kuleuven.be -- Ida Tassens K.U.Leuven, ESAT/SCD (SISTA) Kasteelpark Arenberg 10 B-3001 Leuven, Belgium Tel. +32/16/32.17.09 Fax. +32/16/32.19.70 ida.tassens(a)esat.kuleuven.be -- Ida Tassens K.U.Leuven, ESAT/SCD (SISTA) Kasteelpark Arenberg 10 B-3001 Leuven, Belgium Tel. +32/16/32.17.09 Fax. +32/16/32.19.70 ida.tassens(a)esat.kuleuven.be -- Ida Tassens K.U.Leuven, ESAT/SCD (SISTA) Kasteelpark Arenberg 10 B-3001 Leuven, Belgium Tel. +32/16/32.17.09 Fax. +32/16/32.19.70 ida.tassens(a)esat.kuleuven.be -- Ida Tassens K.U.Leuven, ESAT/SCD (SISTA) Kasteelpark Arenberg 10 B-3001 Leuven, Belgium Tel. +32/16/32.17.09 Fax. +32/16/32.19.70 ida.tassens(a)esat.kuleuven.be -- Ida Tassens K.U.Leuven, ESAT/SCD (SISTA) Kasteelpark Arenberg 10 B-3001 Leuven, Belgium Tel. +32/16/32.17.09 Fax. +32/16/32.19.70 ida.tassens(a)esat.kuleuven.be -- Ida Tassens K.U.Leuven, ESAT/SCD (SISTA) Kasteelpark Arenberg 10 B-3001 Leuven, Belgium Tel. +32/16/32.17.09 Fax. +32/16/32.19.70 ida.tassens(a)esat.kuleuven.be -- Ida Tassens K.U.Leuven, ESAT/SCD (SISTA) Kasteelpark Arenberg 10 B-3001 Leuven, Belgium Tel. +32/16/32.17.09 Fax. +32/16/32.19.70 ida.tassens(a)esat.kuleuven.be -- Ida Tassens K.U.Leuven, ESAT/SCD (SISTA) Kasteelpark Arenberg 10 B-3001 Leuven, Belgium Tel. +32/16/32.17.09 Fax. +32/16/32.19.70 ida.tassens(a)esat.kuleuven.be -- Ida Tassens K.U.Leuven, ESAT/SCD (SISTA) Kasteelpark Arenberg 10 B-3001 Leuven, Belgium Tel. +32/16/32.17.09 Fax. +32/16/32.19.70 ida.tassens(a)esat.kuleuven.be -- Ida Tassens K.U.Leuven, ESAT/SCD (SISTA) Kasteelpark Arenberg 10 B-3001 Leuven, Belgium Tel. +32/16/32.17.09 Fax. +32/16/32.19.70 ida.tassens(a)esat.kuleuven.be -- Ida Tassens K.U.Leuven, ESAT/SCD (SISTA) Kasteelpark Arenberg 10 B-3001 Leuven, Belgium Tel. +32/16/32.17.09 Fax. +32/16/32.19.70 ida.tassens(a)esat.kuleuven.be Disclaimer: http://www.kuleuven.be/cwis/email_disclaimer.htm

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séminaire bioinformatique A. Taton, vendredi
by Annick Wilmotte 11 Jan '08

11 Jan '08

Séminaire CIP, vendredi 11 janvier, 10H30, local 1.75 (B6c) BioBIKE, un environnement bioinformatique intégré et accessible par le Web pour lanalyse comparative de génomes Arnaud Taton, Jonny Casey, JP Massar, Bogdan Mihai, John Myers, Nihar Sheth, Mark Slupesky, Mike Travers, Peter Seibel, Jeff Shrager & Jeff Elhai Center for the Study of Biological Complexity, Virginia Commonwealth University, Richmond, VA Ces dernières années, les biologistes ont été confrontés à une quantité trop importante de données. Cette masse de données génomiques, protéomiques et autres données expérimentales est précieuse, mais la convertir en connaissance requiert une intervention humaine. Ce processus peut être facilité mais non automatisé. BioBIKE (Biological Integrated Knowledge Environment) est un outil pour rassembler les données intéressant les biologistes et analyser ces données de manière nouvelle et créative. BioBIKE comprend une base de données pour un groupe homogène dorganismes (ex. bactéries photosynthétiques, virus) et un environnement de programmation. Il connaît les concepts communs de biologie moléculaire (e.g. traduction et orthologues), il offre une interface commune pour plusieurs outils bioinformatiques (ex. RNAz, MEME et PHYLIP) et peut combiner lanalyse de génomes avec des données de microarrays, les domaines Pfam, les cycles métaboliques et dautres informations disponibles à partir de diverses ressources (ex. KEGG et GenBank). Accessible via le Web et inclus dans une interface graphique, BioBIKE a la flexibilité et le potentiel dun langage de programmation (ex. pour effectuer des tâches répétitives et créer de nouveaux outils) mais permet aux biologistes sans expérience en programmation de programmer lordinateur pour réaliser des analyses suggérées par le problème. Plusieurs instances BioBIKE sont publiquement opérationnelles pour les Streptococci, les virus, les bactéries photosynthétiques. Les cyanobactéries feront lobjet de ce séminaire. *************************************************************************************************** CIP ( <http://www.ulg.ac.be/cingprot/>http://www.cip.ulg.ac.be<http://www.ulg.ac.be/cingprot/>/) Institute of Chemistry Sart Tilman B6 University of Liège B-4000 Liège, Belgium Tel: 32 4 366 38 56 / 33 87 Fax: 32 4 366 33 64 !!!!Visit the website of Micromat, MIDI-CHIP, LAQUAN, B-BLOOMS, AMBIO: <http://www.nerc-bas.ac.uk/public/mlsd/micromat/>www<http://www.nerc-bas.ac.uk/public/mlsd/micromat/>.nerc-bas.ac.uk/public/mlsd/micromat/ , http://www.cip.ulg.ac.be/midichip/ www.LAQUAN.UGent.be, www.bblooms.ulg.ac.be, www.ambio.ulg.ac.be Eager to eat cyanobacteria in space? look at http://ecls.esa.int/ecls/?p=melissa Belgian polar research cluster BE-POLES : http://www.belspo.be/belspo/BePoles/index_en.stm *****************************************************************************************************

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job Software Developer
by Stefanie De Bodt 08 Jan '08

08 Jan '08

============================ We are seeking a Software Developer ============================ Het Department voor Planten Systeembiologie, VIB, Universiteit Gent (www.psb.ugent.be <http://www.psb.ugent.be/>) is een internationaal gerenommeerde, dynamische onderzoeksgroep die moleculaire genetica, genoomanalyses en bioinformatica gebruikt om ontwikkelingsprocessen in planten te ontrafelen, geleid door Prof. Dirk Inzé. Jobomschrijving: Je staat in voor software development in bioinformatica en data mining in de context van onderzoek naar het verhogen van opbrengst bij planten. Het ontwikkelen van visualisaties en webinterfaces voor bestaande tools zowel als het ontwikkelen van nieuwe software en websites behoren tot je takenpakket. Startdatum: zo snel mogelijk, de positie blijft open tot een geschikte kandidaat gevonden wordt. Profiel: * Je bezit een diploma Graduaat, Industrieel Ingenieur of Bachelor/Master Informatica * Je hebt ervaring in MySQL, C++, Java, PHP. * Je spreekt vlot Engels. * Je bent communicatief, een team player. Je bent onafhankelijk en neemt graag initiatief. Je bent flexibel. * Ervaring in bioinformatica en data mining is niet vereist, maar enige interesse is een pluspunt. Aanbod: Wij bieden een contract van bepaalde duur voor 5 jaar, binnen Universiteit Gent, met mogelijkheid tot verlenging. Wij bieden een afwisselende job in een jong team, in een open en informele werksfeer en een moderne werkomgeving. Informatie: Verdere informatie kan verkregen worden bij Stefanie De Bodt (stefanie.debodt(a)psb.ugent.be) Applicatie: Stuur je sollicitatie samen met je CV en eventuele referenten naar: Hilde Diegenant Department of Plant Systems Biology Technologiepark 927 9052 Gent Tel: +32 93313806 of via email naar hilde.diegenant(a)psb.ugent.be <mailto:hilde.diegenant@psb.ugent.be> -- ================================================================== Stefanie De Bodt, PhD VIB Department of Plant Systems Biology, UGent Bioinformatics and Evolutionary Genomics Technologiepark 927 B-9052 Gent Belgium Tel: 32 (0)9 3313692 Website: http://bioinformatics.psb.ugent.be ==================================================================

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